Pondok Pesantren Mojosari berdiri pada tahun 1710 M, menjadikannya sebagai salah satu pesantren tertua tidak hanya di Kabupaten Nganjuk, tetapi juga di kawasan Pulau Jawa. Pesantren ini didirikan oleh As-Syekh K.H. Az Zahid Ali Imron, keturunan Brawijaya Majapahit dan Syekh Al-Maghribi. Lokasinya berada di Dusun Mojosari, Desa Ngepeh, Kecamatan Loceret, Kabupaten Nganjuk.

Pada tahun 2023, PBNU memberikan penganugerahan sebagai Pondok Pesantren tertua ke-2 di Indonesia yang masih aktif dan eksis hingga kini—sebuah pengakuan atas kiprah panjangnya dalam mencetak ulama, pendidik, dan pejuang Islam di Nusantara.

K.H. Ali Imron, pendiri pesantren, merupakan putra Demang Lawu yang menuntut ilmu di Pondok Bendungan Nganjuk di bawah asuhan Kiai Syekh Salimin, menantu Mbah Arfiyah Awwal Mojoduwur. Setelah menimba ilmu, beliau diperintahkan gurunya untuk mencari tempat “wingit” (angker) guna dijadikan pusat penyebaran Islam.
Dengan tirakat panjang—berpuasa dan hanya berbuka dengan sebutir jagung setiap hari selama 40 hari—beliau berhasil membuka hutan lebat di wilayah Mojosari dan mendirikan pondok pesantren yang kelak menjadi salah satu pusat dakwah dan pendidikan Islam di Jawa Timur.

K.H. Ali Imron wafat pada tahun 1791 M dan dimakamkan di Desa Bendugrejo. Kepemimpinan pesantren kemudian diteruskan oleh para penerus beliau secara turun-temurun:

1. K.H. Ali Imron (1720–1791 M)

2. K.H. Abdul Mu’id (1791–1821 M)

3. K.H. Zainuddin bin Abror (1821–1860 M)

4. K.H. Nur Muhyidin (1860–1880 M)

5. K.H. Zainuddin bin Mu’min (1880–1954 M)

6. K.H. Zaini Shobir bin Shidiq (1954–1957 M)

7. K. Syamsul Anam bin Zaini (±6 bulan)

8. K.H. Manshur Sholeh (1958–2006 M)

9. K.H. Ahmad Basthomi Zaini (1987–2004 M)

10. K.H. Mujab Mujib (2006–2010 M)

11. K.H. Muhammad Nasih Basthomi (2010–sekarang)

Di antara para santri ternama yang pernah menimba ilmu di Mojosari adalah Hadratussyaikh K.H. Hasyim Asy’ari, K.H. Wahab Chasbullah, K.H. Abdul Jalil Mustaqim (Tulungagung), K.H. Toha (Bandar Kediri), dan banyak tokoh lainnya.